Ejercicio 6 - Alineament de seqüències, BLAST i filogènia m… · Biología II UB Examen de Bioinformàtica

Tema: Alineament de seqüencies, BLAST i filogenia molecular · Del examen Examen de Bioinformàtica

Enunciado

Preguntes 51-60. Microarrays, anotació procariota i optimització d'alineaments

b.

Donat l'alineament peptídic següent:

KE - - TTVFENL

K - DS -TVFESL

Fent servir una matriu d'identitats (Match = 5, Mismatch = -5) i un cost d'inserció de buit d'obertura (A) = -2 i extensió (B) = -1 mitjançant la fórmula W=A+B⋅(N−1)W = A + B \cdot (N - 1): Quina és la puntuació total?

h.

Davant de dues cadenes qualsevol S1 i S2 amb un esquema de costos definit, quina asseveració és absolutament correcta?

i.

Si en alinear dues proteïnes es canvien els paràmetres de penalització de buits o la matriu d'intercanvi, és possible que variï l'alineament òptim resultant?

j.

Un alineament per parelles de tipus local òptim:

Enunciado: Ejercicio 6 - Alineament de seqüències, BLAST i filogènia m… · Biología II UB Examen de Bioinformàtica

Solución

Según los criterios oficiales de corrección

b. Donat l'alineament peptídic següent: KE - - TTVFENL / K - DS -TVFESL ... Quina és la puntuació total?

Solución: 3. 18

h. Davant de dues cadenes qualsevol S1 i S2 amb un esquema de costos definit, quina asseveració és absolutament correcta?

Solución: 2. La puntuació de l'alineament òptim local sempre és superior o igual a la de l'òptim global.

i. Si en alinear dues proteïnes es canvien els paràmetres de penalització de buits o la matriu d'intercanvi, és possible que variï l'alineament òptim resultant?

Solución: 4. Sí, en variar la funció objectiu de puntuació, l'alineament que assoleix el màxim pot diferir de l'obtingut amb paràmetres previs.

j. Un alineament per parelles de tipus local òptim:

Solución: 4. És la disposició d'alineament local que assoleix la puntuació més elevada possible sota les regles fixades.

La explicación paso a paso, hecha con IA, es Premium. Premium

Resuélvelo aquí mismo: corrección automática, pistas y solución paso a paso.

‹ Ejercicio 5 - Alineament de seqüències, BLAST i filogènia m… · Examen de Bioinformàtica · Ejercicio 7 - Alineament de seqüències, BLAST i filogènia m… · Examen de Bioinformàtica ›

Más ejercicios de Alineament de seqüencies, BLAST i filogenia molecular