Ejercicio 8 - Alineament de seqüències, BLAST i filogènia m… · Biología II UB Examen de Bioinformàtica

c. Quina d'aquestes modificacions de paràmetres a BLAST incrementa el cost computacional fent que la cerca sigui més lenta?

Solución: 3. Definir una mida de paraula ('word size') més petita.

e. Per tal de tenir la seguretat que dues seqüències gèniques són ortòlogues, quin procediment és metodològicament sòlid?

Solución: 4. Construir un arbre filogenètic a partir de l'alineament de les seqüències i observar si formen clades coherents amb la filogènia de les espècies.

h. Si un algorisme d'alineament troba la solució òptima entre dues seqüències, vol dir que es tracta de l'alineament biològicament correcte?

Solución: 4. No, haver assolit la puntuació matemàtica màxima sota un model no garanteix per si sol que representi la realitat biològica o evolutiva.