Ejercicio 1 - Alineament de seqüències, BLAST i filogènia m… · Biología II UB Examen de Bioinformàtica

Tema: Alineament de seqüencies, BLAST i filogenia molecular · Del examen Examen de Bioinformàtica

Enunciado

Context

Avaluació global de coneixements sobre eines bioinformàtiques, maneig de repositoris primaris i secundaris de seqüències, algoritmes d'alineament de parelles i múltiple, cerca d'homòlegs mitjançant BLAST, anàlisi d'expressió diferencial (microarrays i RNA-seq) i disseny d'estratègies computacionals en genòmica.

Preguntes 1-10. Cerca a bases de dades i BLAST bàsic

f.

Per acarar dues proteïnes homòlogues que presenten un grau d'evolució molt divergent (molt allunyades), quina combinació de matrius de substitució s'aconsella emprar?

i.

Quina implicació té el fet que BLAST utilitzi un procediment heurístic en comptes d'un algorisme exhaustiu (com Smith-Waterman)?

j.

Si es vol confirmar de manera fidedigna la condició d'ortologia entre un grup de gens identificats:

Enunciado: Ejercicio 1 - Alineament de seqüències, BLAST i filogènia m… · Biología II UB Examen de Bioinformàtica

Solución

Según los criterios oficiales de corrección

f. Per acarar dues proteïnes homòlogues que presenten un grau d'evolució molt divergent (molt allunyades), quina combinació de matrius de substitució s'aconsella emprar?

Solución: 1. BLOSUM45 o PAM250.

i. Quina implicació té el fet que BLAST utilitzi un procediment heurístic en comptes d'un algorisme exhaustiu (com Smith-Waterman)?

Solución: 3. Guanya en rapidesa d'execució assumint un lleuger risc de no trobar la solució matemàticament òptima.

j. Si es vol confirmar de manera fidedigna la condició d'ortologia entre un grup de gens identificats:

Solución: 3. A partir de les seqüències recollides del BLAST s'ha de construir un arbre filogenètic per comprovar l'agrupament dels ortòlegs.

La explicación paso a paso, hecha con IA, es Premium. Premium

Resuélvelo aquí mismo: corrección automática, pistas y solución paso a paso.

Ejercicio 2 - Alineament de seqüències, BLAST i filogènia m… · Examen de Bioinformàtica ›

Más ejercicios de Alineament de seqüencies, BLAST i filogenia molecular