Ejercicio 4 - Alineament de seqüències, BLAST i filogènia m… · Biología II UB Examen de Bioinformàtica

b. Donat l'alineament següent: GTACGTACG / GTTC - - - CC. Fixant com a regles de puntuació: Match = 3, Mismatch = -1, obertura de gap (A) = -3 i extensió de gap (B) = -1, calculant la penalització de gap com W = A + B · (N - 1): Quina puntuació global obté l'alineament?

Solución: 3. 5

g. Si es persegueix un alineament global entre dues cadenes que toleri poques insercions i, quan n'hi hagi, penalitzi poc que siguin curtes, quina configuració de penalitzacions per buit és més coherent?

Solución: 2. Open = -18, Residue = -2.

i. Indiqueu quina de les asseveracions següents és FALSA respecte als mètodes d'alineament:

Solución: 2. Mai s'apliquen algorismes heurístics a l'alineament local de dues seqüències.

j. Quina d'aquestes afirmacions sobre alineament múltiple és FALSA?

Solución: 4. Només existeixen dos programes desenvolupats per resoldre l'alineament de múltiples seqüències.