Ejercicio 6 - Patrons, predicció de gens i anàlisi de micro… · Biología II UB Examen de Bioinformàtica

a. La localització i anotació de gens en genomes d'organismes eucariotes resulta més complexa que en procariotes a causa de:

Solución: 2. L'estructura gènica interrompuda per introns i la presència de splicing alternatiu.

c. Per quin motiu és preceptiu normalitzar les intensitats de fluorescència en un assaig de microarrays?

Solución: 3. Per compensar biaixos d'origen tècnic (marcatge, quantitat d'RNA, escaneig) i fer plenament comparables els diferents xips.

d. Per establir la presència d'un gen en una seqüència de DNA d'un bacteri o arqueu:

Solución: 3. S'ha d'identificar un codó d'inici associat a un marc obert de lectura prou llarg (ORF).

e. Quina de les opcions següents és FALSA?

Solución: 3. Babelomics és un repositori d'anàlisi de dades transcriptòmiques, no pas una base de dades crues de microarrays.

f. En la inspecció de dades transcriptòmiques d'expressió mitjançant PCA prèvia a qualsevol model estadístic, quin és el propòsit clau?

Solución: 2. Comprovar que les mostres del mateix grup experimental es mantenen agrupades i clarament separades dels altres grups.

g. Dins de la suite Babelomics, en dur a terme un contrast entre classes, què s'aconsegueix seleccionant la mesura de 'fold-change'?

Solución: 2. Ranquitjar i ordenar els gens d'acord amb la magnitud de la seva diferència relativa d'expressió per mostrar els més alterats.