Ejercicio 5 - Patrons, predicció de gens i anàlisi de micro… · Biología II UB Examen de Bioinformàtica

b. Per quina raó en l'estudi d'expressió diferencial s'utilitza habitualment el valor de p ajustat en comptes del p-valor ordinari?

Solución: 1. Per compensar el risc de falsos descobriments derivat de contrastar simultàniament milers de gens (correcció de tests múltiples).

d. Quan en la predicció de dianes de factors de transcripció es parla d'un elevat nombre de falsos positius, s'està expressant:

Solución: 3. Que es prediuen més senyals putatius dels que tenen rellevància biològica funcional en la cèl·lula.

f. Un diagrama gràfic de tipus 'Sequence Logo' il·lustra visualment:

Solución: 4. La conservació de cada posició expressada en bits juntament amb la proporció relativa de cada nucleòtid o aminoàcid.

g. Quants marcs de lectura conceptuals potencials es poden analitzar en una molècula de DNA de doble cadena?

Solución: 2. 6 marcs (3 a la cadena sentit i 3 a l'antisentit).

h. Quina de les definicions següents concorda millor amb el concepte de 'patró de seqüència' (prosite pattern)?

Solución: 3. Una expressió regular que descriu els residus tolerats i estrictament conservats d'una regió funcional d'una família proteica.

i. Quin és el patró PROSITE que millor descriu la regió més conservada?

Solución: 2. G-[FI]-G-F-[IV]-[ST]-F.