Ejercicio 10 - Patrons, predicció de gens i anàlisi de micr… · Biología II UB Examen de Bioinformàtica

a. En l'anàlisi bioinformàtica de dades d'RNA-Seq, assenyaleu quina de les asseveracions següents és FALSA:

Solución: 4. Per poder dur a terme l'alineament o anàlisi de lectures cal disposar necessàriament d'un genoma o transcriptoma de referència previ de l'organisme d'estudi (l'acoblament de novo permet analitzar dades sense referència prèvia).

d. En un estudi d'RNA-Seq, per quina raó es fa servir la mètrica de normalització RPKM (Reads Per Kilobase of transcript per Million mapped reads)?

Solución: 3. Per normalitzar el recompte tant per la mida del transcrit com pel volum total de seqüenciació, permetent comparar diferents transcrits i mostres.

k. En el context d'un experiment d'RNA-Seq, quina de les següents afirmacions és FALSA?

Solución: 4. És totalment impossible analitzar les lectures d'RNA-Seq si no es disposa prèviament d'un genoma o transcriptoma de referència de l'organisme (ja que es pot fer acoblament de novo).