Ejercicio 3 - Bases de dades biològiques i navegadors genòm… · Biología II UB Examen de Bioinformàtica

a. BioMart actua bàsicament com una interfície accessible des del navegador dissenyada per accedir a:

Solución: 4. Bases de dades heterogènies d'anotació genòmica integrada.

c. En configurar filtres de selecció a EnsMart:

Solución: 4. Cal verificar la coherència dels criteris evitant opcions incompatibles amb la cerca de gens homòlegs.

d. En emprar termes clau a SRS buscant 'U1 snRNA' i obtenir hits com 'U11' o 'U1A', a què és degut?

Solución: 4. Indica una formulació millorable de la cerca, que s'hauria d'afinar amb termes més concrets o quotes.

g. A més de connectar diverses fonts de dades biològiques, el sistema web SRS:

Solución: 4. Permet redirigir de manera àgil les dades recuperades cap a diverses eines d'anàlisi computacional.

h. Per quin motiu dbSNP inclou les entrades originals (SS, 'submitted SNP') com a referències a més del registre consens (RS)?

Solución: 3. Perquè permeten documentar l'evidència experimental i la variabilitat inicial de les mostres que caracteritzen el polimorfisme.

i. Quines de les següents prestacions estan integrades tant en portals d'escala com Ensembl com en recursos especialitzats com FlyBase?

Solución: 4. Totes les opcions anteriors formen part de les seves funcionalitats habituals.

j. Els registres ss5586284, ss86344565 i ss227549947 estan vinculats al mateix polimorfisme rs16941 (mutació Glu > Gly a BRCA1). Quina interpretació té?

Solución: 4. Es tracta d'aportacions o assajos independents provinents de diferents poblacions o laboratoris que donen suport a una mateixa variant consens.