Ejercicio 1 - Bases de dades biològiques i navegadors genòm… · Biología II UB Examen de Bioinformàtica

a. Quina utilitat té el botó 'RESULTS' situat a la barra superior d'eines a BioMart?

Solución: 3. Facilita la recuperació dels camps i atributs triats en fer la cerca.

b. Indiqueu quina distinció existeix entre un proveïdor de recursos bioinformàtics i una base de dades:

Solución: 1. El proveïdor integra utilitats d'anàlisi i accés a un ventall nombrós de bases de dades.

c. Atès que FlyBase és una base de dades secundària rica en informació i anotacions sobre Drosophila:

Solución: 2. Disposa d'una comunitat científica darrere dedicada a revisar, incorporar i millorar les anotacions.

d. Per comprovar si una seqüència de DNA ja es troba dipositada als arxius mundials de nucleòtids:

Solución: 3. N'hi ha prou interrogant un dels tres membres del consorci INSDC (GenBank, EMBL o DDBJ).

e. Quina conseqüència biològica comporta un canvi no sinònim (mutació de tipus missense) derivat d'un SNP?

Solución: 2. La conformació o funcionalitat de la proteïna pot variar perquè l'aminoàcid codificat és diferent.

g. Quins són els tres elements fonamentals requerits per establir una consulta a les bases de dades?

Solución: 4. La selecció de la base de dades diana, la definició de filtres i l'elecció dels atributs desitjats.

h. Pel que fa a l'entorn web d'EnsMart (BioMart a Ensembl):

Solución: 4. Ofereix la generació automàtica de codi de programació (Perl, XML...) per automatitzar les cerques.