Ejercicio 2 - Bases de dades biològiques i navegadors genòm… · Biología II UB Examen de Bioinformàtica

b. Davant d'una cerca a la base de dades EMBL, la clau 'adenylate' ofereix 33742 registres i la clau 'kinase' en dona 1146072. Quants resultats pot oferir la combinació 'adenylate AND kinase'?

Solución: 3. La intersecció lògica dels conjunts, és a dir, una xifra continguda necessàriament entre 0 i 33742.

d. Assenyaleu quina de les asseveracions següents és certa sobre bases de dades d'ortologia:

Solución: 1. Aquests dipòsits especialitzats detallen els procediments d'alineament i anàlisi d'homologia fets servir per assignar l'ortologia o paralogia.

e. Tenen exactament els mateixos camps estructurats totes les bases de dades de DNA, RNA i proteïnes?

Solución: 3. No, cada repositori s'adapta amb camps específics al tipus de seqüència i la seva biologia.

h. BioMart permet configurar cerques d'informació a repositoris biològics mitjançant:

Solución: 1. Formularis interactius estructurats en entorn web.

i. En definir els atributs a EnsMart sota la categoria d'estructures, quina informació s'està demanant recuperar?

Solución: 2. Coordenades cromosòmiques i d'anotació.

j. Quina és la raó fonamental per la qual una mateixa variant SNP apareix referenciada tant al portal d'Ensembl com a dbSNP de l'NCBI?

Solución: 2. Ensembl situa el focus en la representació genòmica i posiciona els SNPs descrits per les seves coordenades precises.