Examen de Bioquímica Estructural i Biologia Molecular UAB 2009 · Setembre

Preguntes test 1-10: Termodinàmica, tampons i propietats de proteïnes

Selecciona les opcions vertaderes per a cadascun dels següents enunciats:

Selecciona les opcions vertaderes per a cadascun dels següents enunciats:

a.

Pel que fa a la magnitud pKa pròpia d'un àcid feble:

)

b.

Un medi aquós que conté quantitats equimolars de $\mathrm{CH_3COOH}$ i $\mathrm{CH_3COONa}$ ($\mathrm{pKa} = 4{,}76$):

)

Preguntes test 1-10: Termodinàmica, tampons i propietats de proteïnes

Selecciona les opcions vertaderes per a cadascun dels següents enunciats:

Selecciona les opcions vertaderes per a cadascun dels següents enunciats:

c.

Sobre el paràmetre termodinàmic de variació d'energia lliure estàndard ($\Delta G^\circ$):

d.

Quan una transformació del tipus $\text{A} \rightleftharpoons \text{B}$ assoleix l'estat d'equilibri dinàmic:

e.

D'entre els factors que justifiquen l'elevat caràcter exergònic de la hidròlisi d'ATP ($\Delta G^\circ = -30{,}5\text{ kJ/mol}$):

f.

Atesos els següents valors de $\Delta G^\circ$ d'hidròlisi: glucosa-6-P ($-13{,}8\text{ kJ/mol}$), acil-CoA ($-32{,}3\text{ kJ/mol}$), fosfoenolpiruvat ($-61{,}9\text{ kJ/mol}$) i fosfocreatina ($-43{,}0\text{ kJ/mol}$), quins poden acoblar-se directament per cedir fosfat a l'ADP i sintetitzar ATP ($\Delta G^\circ\text{ d'hidròlisi} = -30{,}5\text{ kJ/mol}$) de forma espontània?

Preguntes test 1-10: Termodinàmica, tampons i propietats de proteïnes

Selecciona les opcions vertaderes per a cadascun dels següents enunciats:

g.

Assenyala quines parelles d'aminoàcids posseeixen cadenes R amb capacitat per interactuar entre si mitjançant enllaços d'hidrogen:

h.

Identifica les interaccions estabilitzadores compatibles amb el plegament terciari nadiu d'estructures globulars:

i.

L'oligopèptid de seqüència Glu-His-Asn-Lys conté:

Preguntes test 1-10: Termodinàmica, tampons i propietats de proteïnes

Selecciona les opcions vertaderes per a cadascun dels següents enunciats:

j.

Determina quins dels següents moduladors de la transició al·lostèrica T/R de l'hemoglobina actuen com a efectors heterotròpics:

2 Preguntes test 11-20: Hemoglobina, catalitzadors i àcids nucleics

Tria les afirmacions vàlides per a cadascuna de les qüestions:

a)

En comparar la variant fetal (HbF) amb l'adulta (HbA) de l'hemoglobina:

b)

Diferències entre els estats conformacionals tens (T) i relaxat (R) de l'hemoglobina:

2 Preguntes test 11-20: Hemoglobina, catalitzadors i àcids nucleics

Tria les afirmacions vàlides per a cadascuna de les qüestions:

c.

En relació als fonaments de l'acció catalítica dels enzims:

)

d.

Pel que fa al criteri oficial de classificació enzimàtica:

)

e.

Quin patró d'inhibició enzimàtica és capaç d'incrementar la Km aparent mantenint inalterada la Vmàx?

)

f.

El sistema transportador de glucosa eritrocitari (GLUT1):

)

2 Preguntes test 11-20: Hemoglobina, catalitzadors i àcids nucleics

Tria les afirmacions vàlides per a cadascuna de les qüestions:

g.

Quina opció permet assolir l'aïllament i purificació d'una proteïna diana d'interès en un únic procediment gràcies a la seva alta especificitat?

)

2 Preguntes test 11-20: Hemoglobina, catalitzadors i àcids nucleics

Tria les afirmacions vàlides per a cadascuna de les qüestions:

h.

Pel que fa a les bases nitrogenades presents als àcids nucleics:

)

2 Preguntes test 11-20: Hemoglobina, catalitzadors i àcids nucleics

Tria les afirmacions vàlides per a cadascuna de les qüestions:

i. Característiques definidores de les ARN polimerases dependents d'ADN:

2 Preguntes test 11-20: Hemoglobina, catalitzadors i àcids nucleics

Tria les afirmacions vàlides per a cadascuna de les qüestions:

j. En la maquinària de replicació, les ADN polimerases exigeixen per actuar:

)

3 Preguntes test 21-30: Expressió gènica, transducció i vies metabòliques

Marca les opcions que siguin correctes:

Marca les opcions que siguin correctes:

a. Pel que fa a les telomerases:

)

3 Preguntes test 21-30: Expressió gènica, transducció i vies metabòliques

Marca les opcions que siguin correctes:

Marca les opcions que siguin correctes:

b. El procés d'edició o modificació posttranscripcional de l'ARN (RNA editing) comprèn:

)

3 Preguntes test 21-30: Expressió gènica, transducció i vies metabòliques

Marca les opcions que siguin correctes:

Marca les opcions que siguin correctes per a cada apartat:

c.

Sobre les característiques del codi genètic:

)

e.

En la biosíntesi de cadenes polipeptídiques en cèl·lules procariotes:

)

3 Preguntes test 21-30: Expressió gènica, transducció i vies metabòliques

Marca les opcions que siguin correctes:

d. Indica les premisses vàlides relatives al control genètic de l'operó de la lactosa:

3 Preguntes test 21-30: Expressió gènica, transducció i vies metabòliques

Marca les opcions que siguin correctes:

f.

Trets fonamentals de les branques del metabolisme intermediari (anabolisme i catabolisme):

)

g.

Sobre l'estructura i funció de les proteïnes G de caràcter heterotrimèric:

)

h.

La fosfolipasa C implicada en la hidròlisi de fosfoinosítids:

)

i.

La fixació de la insulina al seu receptor específic:

)

j.

Pel que fa a les cascades de comunicació intracel·lular:

)

4. Preguntes test 31-40: Cicle de Krebs, fosforilació i glúcids

Tria les opcions vertaderes relacionades amb el metabolisme energètic:

.

5. Preguntes test 41-50: Metabolisme de lípids, nitrogen i nucleòtids

Tria les asseveracions correctes sobre cadascun dels processos següents:

.

Pregunta de desenvolupament 1: Anàlisi de mutacions gèniques i diana HindIII

Es disposa d'un fragment d'un gen determinat en el qual s'han identificat dues variants mutades puntuals, anomenades A i B. Les seqüències de la cadena codificant d'ADN són les següents:

Al·lel normal: ATT CGA AGC TTA GGC (Ile...)

Al·lel mutant A: ATT CGA AGC TAA GGC (Ile...)

Al·lel mutant B: ATT CGA AGC TTG GGC (Ile...)

a)

Quina de les dues mutacions comportarà la síntesi d'una cadena polipeptídica alterada? Especifica quin canvi tindrà lloc en la seqüència primària.

Pregunta de desenvolupament 1: Anàlisi de mutacions gèniques i diana HindIII

Es disposa d'un fragment d'un gen determinat en el qual s'han identificat dues variants mutades puntuals, anomenades A i B. Les seqüències de la cadena codificant d'ADN són les següents:

Al·lel normal: ATT CGA AGC TTA GGC (Ile...)

Al·lel mutant A: ATT CGA AGC TAA GGC (Ile...)

Al·lel mutant B: ATT CGA AGC TTG GGC (Ile...)

b)

Quina de les mutacions es pot diagnosticar mitjançant una estratègia de PCR seguida de digestió amb l'enzim de restricció HindIII (diana de tall: 5'-AAGCTT-3') i resolució electroforètica en gel d'agarosa?

7 Pregunta de desenvolupament 2: Sistema tampó bicarbonat i hipoventilació

Respon als següents apartats sobre l'equilibri àcid-base a l'organisme humà:

a.

Escriu l'expressió de Henderson-Hasselbalch que relaciona el pH sanguini amb les concentracions de diòxid de carboni dissolt i de l'ió bicarbonat.

b.

Explica raonadament quina repercussió tindrà un quadre d'hipoventilació pulmonar (provocat, per exemple, per una obstrucció en les vies aèries) sobre els valors del pH plasmàtic i sobre les concentracions de $\text{CO}_2$ i $\text{HCO}_3^-$.

8 Pregunta de desenvolupament 3: Cinètica enzimàtica mitjançant representació lineal

A partir de l'estudi d'un enzim en absència i presència d'un compost inhibidor (a concentració 1 mM), es va aplicar la transformació de Lineweaver-Burk obtenint-se les següents interseccions amb els eixos:

Paràmetre · En absència d'inhibidor · En presència d'inhibidor (1 mM)

Tall amb l'eix d'ordenades (Tall Y, $\mu\text{mol}^{-1}\cdot\text{min}$) · 0,2 · 0,2

Tall amb l'eix d'abscisses (Tall X, $\text{mM}^{-1}$) · -2,0 · -0,5

a.

Calcula els valors de la velocitat màxima ($V_{\text{màx}}$) i de la constant de Michaelis ($K_m$) en ambdues condicions de l'assaig.

b.

Identifica de quin tipus d'inhibició es tracta justificant la conclusió.

c.

En absència d'inhibidor i partint d'una quantitat inicial de substrat de 0,1 M, quina quantitat de substrat s'haurà consumit després de 4 minuts de reacció?

Pregunta de desenvolupament 4: Estructura, càrrega i pI d'un pèptid

Considera l'estructura química del pèptid següent:

a.

Escriu la seqüència del pèptid fent servir el codi d'aminoàcids de tres lletres.

b.

Assigna a quins grups ionitzables de la molècula correspon cadascun dels següents valors de pKa proporcionats: 3,1 (C-terminal), 8,0 (N-terminal), 4,1 i 6,0.

c.

Determina de manera breument raonada la càrrega elèctrica neta predominant d'aquest pèptid a pH fisiològic (7,4).

d.

Calcula el seu punt isoelèctric (pI).

10. Pregunta de desenvolupament 5: Vies de senyalització i segons missatgers

Tria dos segons missatgers diferents de la transducció de senyals cel·lulars. Per a cadascun d'ells, desenvolupa:

a. Les condicions i la reacció mitjançant la qual es biosintetitza.

b. El mecanisme molecular a través del qual exerceix la seva funció sobre les dianes intracel·lulars.

c. El mecanisme enzimàtic o de transport responsable de la seva inactivació o eliminació.

11. Pregunta de desenvolupament 6: Fisiopatologia de la deficiència de miofosforilasa

Avalua les repercussions clíniques i metabòliques de la manca de l'enzim glicogen fosforilasa muscular (característica de la malaltia de McArdle o glucogenosi tipus V). Raona si els individus afectats manifestaran:

a.

Episodis d'hipoglucèmia durant el dejuni.

b.

Acidèmia làctica després de la pràctica d'exercici físic intens.

12. Pregunta de desenvolupament 7: Teràpia combinada contra la hipercolesterolèmia

En el maneig terapèutic de pacients amb hipercolesterolèmia s'acostuma a combinar una pauta nutricional baixa en greixos i colesterol amb la prescripció d'estatines i resines quelants d'àcids biliars.

a.

Justifica el fonament bioquímic que recolza l'administració simultània d'aquesta dieta i ambdós tractaments farmacològics.

b.

Detalla quin és el mecanisme d'acció específic i l'efecte bioquímic provocat per les estatines i per les resines d'intercanvi catiònic/aniònic (segrestadors biliars).

13. Pregunta de desenvolupament 8: Implicacions del dèficit de carbamil fosfat sintetasa I

Explica per quins motius una inhibició total de l'activitat de la carbamil fosfat sintetasa I (CPS-I) a nivell hepàtic resulta incompatible amb la vida. En la teva justificació:

a.

b.

Identifica i escriu la fórmula química d'un metabòlit la concentració sanguínia del qual experimentarà una forta davallada.

c.

Identifica i escriu la fórmula química d'un metabòlit que patirà una acumulació severa i tòxica al plasma.