Exercice 2 · Bac Sciences de la Vie et de la Terre Métropole 2 remplacement 2022
Thème : Complexification des génomes : transferts horizontaux et endosymbioses · Tiré du sujet Métropole France 2 remplacement (2022)
Énoncé
EXERCICE 2: Une maladie mitochondriale, le syndrome NARP (8 POINTS)
Le syndrome NARP (Neuropathie Ataxie et Rétinite Pigmentaire) est une maladie génétique dont les symptômes cliniques apparaissent progressivement. Des recherches ont établi que cette maladie implique l'ATP synthase mitochondriale (ou complexe V), un complexe protéique enzymatique localisé dans la membrane interne des mitochondries.
QUESTION
Montrer qu'une mutation du gène de l'ATP synthase transmise par hérédité cytoplasmique peut être à l'origine du syndrome NARP.
Vous organiserez votre réponse selon une démarche de votre choix intégrant des données des documents et les connaissances utiles.
Document 1: organisation et fonctionnement des complexes enzymatiques de la chaîne respiratoire dans la membrane mitochondriale
Document 2: origine génétique des sous-unités des 5 complexes enzymatiques constituant la chaîne respiratoire
Chaque complexe enzymatique de la chaîne respiratoire est formé de plusieurs sous-unités, codées soit par le génome nucléaire, soit par le génome mitochondrial.
Complexes · Nom · Sous-unités codées par le génome nucléaire · Sous-unités codées par le génome mitochondrial
I · NADH-CoQ réductase · 36 · 7
II · Succinate-CoQ réductase · 4 · 0
III · Ubiquinol-cytochrome c réductase · 10 · 1
IV · Cytochrome c oxydase · 10 · 3
V · ATP synthase · 12 · 2
Source: Pierre Lescuyer. Étude de l'expression des gènes nucléaires codant pour les sous-unités du complexe I mitochondrial humain. Sciences du Vivant [q-bio]. Université Joseph-Fourier - Grenoble I, 2002.
Document 3: arbre généalogique d'une famille dont certains membres souffrent du syndrome NARP
Document 4: devenir de certains organites paternels lors de la fécondation chez Caenorhabditis elegans (un petit ver d'un millimètre environ, transparent et non-parasitaire)
Les microtubules de l'embryon de Caenorhabditis elegans participent à la localisation et à la séquestration des mitochondries spermatiques dans des autophagosomes. Un autophagosome est une structure permettant la dégradation par lyse de certains organites.
Des études ont montré que ce processus, appelé autophagie, participe également à la dégradation des organites paternels chez les mammifères. Néanmoins les mécanismes précis de cette autophagie restent encore à élucider.
Source: d'après Developement, V.Galy
Document 5: électrophorèse des complexes I à V de la chaîne respiratoire dans des cellules provenant d'un individu sain et d'un individu atteint du syndrome NARP
L'électrophorèse a pour but de séparer des molécules chargées au travers d'un gel sous l'effet d'un champ électrique. En fonction de différents paramètres (charge, masse...), la vitesse de migration va être variable, ce qui permet la séparation des différentes molécules. Après révélation avec une technique adaptée, celles-ci sont alors visualisables sous forme de bandes. La présence d'une bande indique la présence d'une molécule.
Le document ci-dessous présente le résultat d'une électrophorèse des complexes I à V de la chaîne respiratoire dans des cellules provenant d'un individu sain et d'un individu atteint du syndrome NARP. Pour en faciliter la lecture, les différentes bandes obtenues ont été replacées dans l'ordre des complexes au sein de la chaîne respiratoire.
CI à CV = complexe I à V de la chaîne respiratoire
Remarque: le décalage visible au niveau du complexe IV est un artéfact, donc non significatif.
Source: d'après Defective mitochondrial ATPase due to rare mtDNA m. 8969G> A mutation—causing lactic acidosis, intellectual disability, and poor growth - P Isohanni, CJ Carroll, CB Jackson, M Pohjanpelto... - neurogenetics, 2018 - Springer
Document 6: évaluation de l'activité de l'ATP synthase
Les protons accumulés dans l'espace intermembranaire grâce aux complexes I, III et IV, créent un gradient de protons entre l'espace intermembranaire et la matrice. Ce gradient permet la synthèse d'ATP par l'ATP synthase (complexe V) à partir d'ADP + Pi. Dans la matrice, les protons se combinent au dernier accepteur d'électrons, le dioxygène, pour former de l'eau:
Consommation d'O₂ dans des cellules provenant d'un individu non-atteint (sain) et d'un individu atteint du syndrome NARP, avant et après ajout d'ADP
ADP = ajout d'ADP
Source: modifié d'après Defective mitochondrial ATPase due to rare mtDNA m. 8969G> A mutation - neurogenetics, 2018

Corrigé
Corrigé proposé par AprenAI (non officiel)
Montrer qu'une mutation du gène de l'ATP synthase transmise par hérédité cytoplasmique peut être à l'origine du syndrome NARP.
Réponse : Une démarche structurée doit aborder : 1. La localisation mitochondriale du gène muté et le mode de transmission cytoplasmique (maternelle) : - D'après le Document 2, le complexe V (ATP synthase) est constitué de 14 sous-unités dont 2 sont codées par le génome mitochondrial. - L'arbre généalogique (Document 3) montre que la maladie n'est transmise que par les femmes atteintes à toute leur descendance (ex. : femme I-2 transmet à ses 4 enfants II-1, II-4, II-6, II-9 ; II-4 et II-9 transmettent à leurs enfants). En revanche, les hommes atteints (II-1, II-6, III-5, III-13) ne transmettent jamais la maladie à leur descendance. Ce mode de transmission non mendélien est caractéristique d'une hérédité mitochondriale / cytoplasmique strictement maternelle. - Le Document 4 explique le mécanisme cellulaire : lors de la fécondation, les mitochondries apportées par le spermatozoïde sont séquestrées dans des autophagosomes et dégradées par autophagie. Seules les mitochondries de l'ovocyte (maternelles) subsistent dans l'embryon. 2. Les conséquences de la mutation sur l'ATP synthase et le métabolisme cellulaire : - Le Document 5 montre que chez l'individu malade, tous les complexes de la chaîne respiratoire (I à V) sont présents en quantité normale. La mutation n'empêche donc pas l'assemblage ni la présence du complexe V dans la membrane interne mitochondriale. - Le Document 1 rappelle que l'oxydation des composés réduits par les complexes I à IV permet l'expulsion de protons vers l'espace intermembranaire, créant un gradient de protons. Le retour de ces protons vers la matrice via l'ATP synthase permet la phosphorylation de l'ADP en ATP. Ce flux est couplé à la réduction finale du dioxygène en eau. - Le Document 6 montre qu'avant ajout d'ADP, la consommation d'O₂ basale est identique chez l'individu sain et malade (~40 pmol/s). Après ajout d'ADP, la consommation d'O₂ augmente fortement chez l'individu sain pour atteindre ~80 pmol/s, alors qu'elle n'augmente que modérément chez le malade (~63 pmol/s). L'ATP synthase mutée fonctionne moins efficacement : le flux de protons à travers le complexe V est réduit, ce qui freine le retour des protons, diminue la synthèse d'ATP et ralentit en retour la chaîne respiratoire et la consommation de dioxygène. 3. Conclusion / mise en relation avec le syndrome NARP : Le déficit de production d'ATP affecte en priorité les cellules à fort besoin énergétique (neurones, cellules musculaires, rétine), expliquant la neuropathie, l'ataxie et la rétinite pigmentaire observées dans le syndrome NARP.
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